O foco do Cebrap é a análise e intervenção na realidade brasileira, com um estilo de trabalho próprio, que enfatiza a comparação, combina especialização e interdisciplinaridade, em diálogo constante entre as diferentes perspectivas teóricas e metodológicas de seus antropólogos, cientistas políticos, demógrafos, economistas, filósofos, historiadores, juristas e sociólogos.
O núcleo de pesquisa, formação e difusão sobre a temática racial tem como objetivo contribuir para o fortalecimento desse campo de investigação, promovendo a produção e circulação de conhecimento qualificado.
O Núcleo de Pesquisa Democracia e Ação Coletiva (NDAC) dedica-se ao estudo de atores societários, seus papeis de mediação política e na produção de políticas públicas
O Núcleo de Desenvolvimento realiza estudos para subsidiar ações do setor público, privado e terceiro setor.
Cebrap Sustentabilidade dedica-se à produção de conhecimentos voltados a favorecer formas inovadoras de tratamento do tema ambiental e que estejam sintonizadas com os principais avanços realizados pela comunidade científica nacional e internacional.
As pesquisas do Núcleo de Cidadania, Saúde e Desenvolvimento enfocam o papel das políticas sociais no enfrentamento das desigualdades e na promoção da participação política, da justiça social e do desenvolvimento.
O Núcleo de Estudos Internacionais (NEI) abriga projetos de pesquisa e outras atividades relacionadas a assuntos internacionais.
O Núcleo Direito e Democracia (NDD) dedica-se à investigação das crises da democracia a partir da tradição da Teoria Crítica e de seus desdobramentos contemporâneos.
O Núcleo de Instituições Políticas e Eleições (NIPE) dedica-se ao estudo dos processos políticos contemporâneos, com especial atenção ao cenário brasileiro.
